浙大儿院急诊科成立于1997年，2006年-2019年曾归属于PICU管理，2019医院新成立的门急诊中心，急诊科成为其中重要部分。经过20多年的发展，急诊科已经形成了一支颇具规模、队伍齐整、技术一流的团队，14年科室成为全国青年文明号。科室是浙江省医学会儿科分会急诊重症医学组组长和副组长所在单位，浙江省最大的儿科急诊中心，也是华东地区乃至全国最大规模的急诊中心之一，在全国具有相当影响力。急诊科下设滨江院区和湖滨院区两个院区，包括急诊抢救室，急诊ICU，急诊留观室，急诊手术室，急诊隔离室等一套完整的功能区域。拥有急诊抢救床14张，手术床2张，留观床48张，隔离床3张，辐射床2张，拥有主任医师4名，副主任医师1名，副主任护师1名，主治医师12名，主管护师11名;博士学历6人，硕士学历20人，医护平均年龄不到40岁。科室提供24小时不间断医疗救治服务，每年接诊患儿近40万人次，抢救2万余人次，总抢救成功率达98.7%，每年开展国家级继续教育项目2项。依托于重症监护病房，急诊科近年参与多次具有较大社会影响力公共事件的急救处理，如：“最美妈妈吴菊萍”幸存患儿妞妞的抢救、“杭州7.5公交纵火事件”伤员救治等，取得了良好社会效应。
